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龟生活的水体必须新鲜，水体透明度应在30厘米左右。乌龟是冷血动物，水温的变化会直接影响乌龟体温的变化。因此，水深应随季节增减。春季，气温较低，水宜浅；夏季气温高，水宜深；秋季，水温逐渐下降，水宜浅；冬季水位要稳定，因为龟的体温随着气温和水温的升降而变化。如果气温急剧下降，水位忽高忽低，乌龟只能利用自身积累的营养物质来调节体温。当体内的营养耗尽后，就会死亡。
一般饲养水龟多采用自来水。基本上是中性水。它的硬度和pH值都符合饲养水龟的要求，所以不用太担心。但用自来水饲养水龟时，必须将其除去。氯。主要方法有干燥法和化学法。干燥方法是在烈日下晒干两天，或在避光条件下晒干4至6天后再使用。化学方法是用硫代硫酸钠去除氯。其比例为每10公斤水加入1克硫代硫酸钠。使用前搅拌并溶解。
在说龟甲上的水碱之前，我们先来说说水碱的形成。我们使用的自来水大多是硬水，其中含有大量的钙、镁离子。当硬水受热或蒸发时，水中溶解的钙离子、镁离子与某些酸离子形成不溶于水的化合物或混合物，其主要成分是碳酸钙。不溶性碳酸钙与其他物质从水中析出形成沉淀物，通常称为水碱。覆盖龟壳的水碱不仅影响美观，更重要的是阻碍龟壳的正常呼吸，影响龟壳的健康生长。因此，必须及时清除龟壳上的水碱。能够去除水和碱的酸性物质有很多种，但是去除龟甲的水和碱，应该使用安全的酸性物质，比如可乐、雪碧、醋等。
用醋去除龟壳上的水和碱。操作方法用牙刷蘸适量食用醋，然后用水和碱在部位上按顺时针或逆时针方向反复刷洗，最后用清水冲洗掉龟身上的脏汁。待龟壳完全干燥后检查。如果仍有水和碱，可重复上述方法数次，直至水和碱完全除去。使用新牙刷。如果是小苗，就选择较软的牙刷，最好是软毛尖头的牙刷。
用可乐和雪碧去除龟甲碱的方法同上。对于较重的水碱，可以用醋去除。对于特别严重的水碱，先用手术刀或其他工具打磨一下，然后再用上述方法进一步去除。
有的养龟爱好者怕水碱，建议用纯净水养龟。这个可以吗？纯净水，所谓纯净水，不含杂质，也就是说纯净水缺乏动物身体所需的矿物质。所以用纯净水养龟就相当于让龟长期喝纯净水，这对龟来说应该是弊大于利。
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